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HOMEDNA 분석 서비스식물 DNA 분석

식물 DNA 분석
식물 DNA 분석
종 분류 DNA 검사

식물의 종(species)을 DNA 분석을 통해 확인하는 검사로 nuclear DNA 또는 chloroplast DNA, mitochondria DNA 중 종 마다 특이성을 나타내는 DNA 부분을 분석해 종을 동정합니다. Nuclear DNA에서는 ITS(Internal transcribed spacer), IGS(Intergenic spacer), ribosomal RNA gene (ex. 18s rDNA, 28s rDNA) 또는 specific gene을 분석하고 cpDNA에서는 ribosomal or transfer RNA gene(ex. trnA(UGC)~Y(GUA), rpl32, rps4 등) 또는 그 spacer, transcription/translation apparatus genes (ex. rpo, atp, pet, psb, ndhA~K, matK, rbcL 등), conserved reading frames (ex. ycf 1~4) 등의 염기서열을 분석해 종을 동정합니다.

  • DNA PCR
  • Sequencing
  • GeneBank searching

그림과 같이 식물 종마다 특이성을 나타내는 DNA의 염기서열을 해독합니다. 유전자은행(GeneBank)에서 이미 보고된 종들과 염기서열을 비교해 종을 확정하게 됩니다.

동일성 검사 및 혈통 확인검사

식물의 모개체로부터 물려받는 반복염기서열(microsatellite DNA)의 반복 횟수를 측정하여 같은 개체로부터 번식된 식물체 인지 또는 그 친자관계가 성립하는지를 확인하는 검사입니다. 식물의 동일성 검사와 혈통 확인 검사는 이에 필요한 연구정보와 분석기술이 알려진 것이 많지 않음으로 사전에 본사의 연구원과 충분한 상의를 하셔야 합니다. 식물은 하나의 모개체로부터 번식된 딸 개체라 하더라도 각각의 표현형(phenotype)은 모 개체와 다를 수 있습니다.

그림과 같이 microsatellite 유전자형을 비교하여 같은 대립유전자형을 나타내는지에 따라 동일성 여부를 결정하며, 모개체와 딸개체간에 공유대립유전자를 보유하고 있는지에 따라 혈통의 진위여부를 결정하게 됩니다.

SNP 분석

SNP 검사는 개체군(population)내 특정 유전자의 단일염기서열 변이(single nucleotide polymorphism, SNP)를 염기서열 해독 또는 fluorescence labeling 방식으로 측정하여 SNP 유전자형(genotype)과 개체의 표현형(phenotype) 간의 연관 관계를 추적하는 검사입니다.

그림과 같이 특정 DNA 위치에서 개체마다 다른 염기서열을 나타내는 구간에 대해 DNA sequencing 또는 형광 probe 방식으로 SNP 유전자형을 결정하게 됩니다